Сегодня музей Бердска включает в себя три структурных подразделения и располагается в четырёх отдельных помещениях — каждый зал рассказывает об интересных событиях и замечательных людях в истории города, о творчестве талантливых художников и мастеров.
Включает в себя зал с экспозицией «Листая книгу Памяти», посвящённой участию Бердска в Великой Отечественной войне и вкладу бердчан в Победу; один большой выставочный и два малых выставочных зала. Тематика большинства выставок связана с историей города Бердска и его жителей. Смена выставок в малых залах — раз в один-два месяца, в большом зале — 1–2 раза в полугодие.
Включает в себя выставочный зал, он же зал для проведения большинства массовых мероприятий, и малый выставочный зал — холл. В этих залах размещаются художественные выставки как из фондов музея, так из частных коллекций, работы художников, мастеров ДПИ. В данном помещении работает структурное подразделение музея — Дом дружбы: место встреч культурных автономий, действующих в Бердске. Также в арт-зале проходят мастер-классы и работает «Музейная Академия искусств», включающая Школу ремёсел, Музейный кинозал и музыкальные лекции.
В зале размещается экспозиция, рассказывающая о жизни и творчестве Народного артиста РФ, бердчанина Владлена Бирюкова. Экспозиция открыта в сентябре 2016 года. Её основу составляют подлинные экспонаты: личные вещи, театральные костюмы, предметы интерьера, документы, фото, переданные Бердску родными и коллегами актёра. В связи с небольшой вместимостью зала его могут посещать группы до 15 человек.
В зале, находящемся на 7 этаже бывшего административного здания радиозавода (ПО «Вега»), размещается историческая экспозиция с радиоаппаратурой, выпускаемой заводом с 1947 года по последний день работы предприятия, фотографии, документы. Экспозиция совмещена с залом для проведения массовых мероприятий (сцена и 100 зрительских мест). В 2017 году в зале выделено две небольшие выставочные зоны для художественных, естественно-научных, технических выставок.
